Chlorofilas a Lietuvos ežeruose pradėtas matuoti nuo 1998 m. o upėse – nuo 2001 m.

Chlorofilo a koncentracija leidžia gana tiksliai nustatyti vandens baseino trofinį statusą ir prognozuoti tuos pakitimus, kurie įvyksta dėl antropogeninės veiklos.

Chlorofilo a koncentracijos duomenys naudojami fitoplanktono biomasės nustatymui, taip pat kaip fotosintezės produkcijos rodiklis. Pagal chlorofilo a koncentracija yra vertinama vandens telkinio trofinė būklė.

Normatyviniame dokumente LAND 56-2003 „ Chlorofilo „a“ kiekio nustatymo metodas fitoplanktone“, patvirtintame Aplinkos ministro 2003 m. gruodžio 24 d. Įsakymu Nr. 708 yra pateikta metodika, kaip nustatoma chlorofilo a koncentracija fitoplanktone.